COM port не может установить скорость выше 9600, т.к. на сканере стоит кварц 3.57МГц. Если Вы хотите установить желаемую скорость необходимо, чтобы на сканере был соответствующий кварц, который указывается рядом со скоростью. Например, для скорости 9600 существует стандарт  ISO-7816. По этой причине некоторые карты не работают на повышенных скоростях.